充滿陽光的沙漠，樓蘭廢墟就在遠處。
從綱手那裡接到協助砂忍村抓捕叛忍傀儡師百足的命令，鳴人、佐井、小櫻，還有他們的隊長大和，四人一路追蹤趕路。
在來的路上，木葉四人小隊和百足的傀儡發生了幾場戰鬥。
當幾人進入樓蘭封印之地的時候，百足正在施術破解四代留下的封印。
鳴人與大和上前阻止，誰曾想百足竟然解開了四代水門的封印！鳴人直接被時空亂流捲入其中。
大和用木遁抓住了鳴人，可是時空亂流的力量太大，他也被捲入其中。
小櫻在接近時空亂流的位置被佐井救下，兩個人懊悔不已。
不過下一刻，兩人就看到了躺在封印之地的鳴人也大和。
鳴人和大和被小櫻喚醒，問清楚情況，原來他們隨著時空亂流被捲入過去。
鳴人和大和回到了木葉四十年，樓蘭古城還在的時空。
鳴人碰見了樓蘭女王，並且在年輕時的波風水門、秋道丁座、油女志彌和六歲的中忍卡卡西幫助下，打敗了同樣是未來回到過去的安祿山（也就是百足）。
最後，波風水門封印龍脈的力量，鳴人和大和也回到了未來時空。
鳴人講完自己的經歷，他們剛剛走出樓蘭遺址，四人就看到了遠處天邊墜落的天礙震星。
“那是什麼？”
“好像月亮掉下來一樣！”
“離村子不遠，我們快去看看！”
四人奔向天礙震星方向。
……
電影就是這麼短的時間。
……
布萊德利呂牧穿過大氣層，他加速飛向太陽的方向。
布萊德利呂牧飛入方舟飛船金字塔，石床上白絕和一邊的天啟帶土還是連體嬰的狀態，黑棒插滿天啟帶土身上，黑棒限制住兩人都聽不懂，不過天啟帶土的意識卻在外面。
“天啟，你的能力殺不死白絕嗎？”布萊德利呂牧說道。
“白絕就像是孢子植物一樣，他能寄生繁殖！紅呂牧和藍呂牧意識對他不起作用。把妖蓮拿出來，讓白呂牧們試試對付他！我的英雄揹包中什麼都沒有！”天啟勉強開口說道。
布萊德利呂牧從英雄揹包中拿出數只蓮妖，天啟帶土趕緊將蓮妖們收進自己的英雄揹包中。
……
天啟帶土的精神世界裡，幾個白呂牧剛剛進來。
整個精神世界裡都是全身白色的“呂牧”形象意識在到處亂飛。
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