【No No No！我並沒有說二維是錯的。
二維卷積在糖質密度圖的區域性質量評估上是有效的，這一點我從來沒有否認。
但你要看到的是維度帶來的根本限制。
二維投影意味著你把三維空間中的結構資訊壓扁到了一個平面上。
在這個過程中，大量空間關係被摺疊、被重疊、被丟失。
你在一張二維圖上看到的區域性模式，可能來自三維空間中完全不同的兩個區域。
它們只是恰好投影到了同一個位置。
你花大量時間在二維空間裡篩選、比對、排除，本質上是在一片被壓縮過的資訊森林裡尋找線索。
而這片森林裡的大部分路徑是無效的、重複的、相互干擾的。
如果我們能夠步入三維，站在更高的維度上，我們就能看得更遠。
三維密度圖保留了結構的空間關係，卷積核可以在真實的幾何空間中學習模式，而不是在投影平面上猜測模式。
相對而言，也更容易找到真正有意義的訊號......】
看到這裡，林曉眉頭微微皺了一下。
他承認勒丘恩關於二維投影會丟失空間關係的說法有道理。
但站在更高的維度就能看得更遠這個判斷，他還是覺得在邏輯上有些太絕對了。
不過他沒有急著下結論，繼續往下看。
【另外，你說糖鏈構象柔性導致區域性模式不穩定，這個判斷在二維下是對的。
但在三維下，構象的變化本身就是一個可以被建模的物件，而不是需要被消除的噪聲。
我們可以在三維空間中追蹤構象的分佈，而不是在二維平面上一張一張地看。
......
所以我的建議是。
不要停留在二維的舒適區。
三維的方向是確定的。
只要我們找到正確的路徑。】
看到這裡。
林曉簡首無語到不知道該說什麼了。
到底有完沒完？
你都承認我的觀點是對的了。
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